Фамилия Ходонина образована от прозвища Ходоня, которое восходит к глаголу «ходить», то есть «двигаться с места, передвигая ногами». Вероятно, Ходонем могли прозвать человека, который много ходил, например, путешественника. Возможно, что прозвище Ходоня происходит от слова «ходатай», то есть «заступник, старатель, проситель за кого; поверенный по делам, частный стряпчий и ходок». Так и прозвище Хадоня закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Хадонин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Хадоня, со временем получил фамилию Хадонин.