Фамилию Хахонов легче всего понять, если отбросить суффикс -ов и присмотреться к основе — Хахон. Это типичная «отчество от прозвища»: в XV–XVII веках так могли назвать человека, а его дети стали Хахоновыми. Ключевой вопрос — что значило само слово «хахон» в древнерусских говорах.

Здесь есть две равноправные версии, и обе имеют под собой лексическую почву. Первая: «хахон» — это вариант слова «хахаль», то есть ухажёр, волокита, любовник. В диалектах русского севера и центра «хахалить» означало «любезничать, ухаживать», а «хахон» — того, кто этим промышляет. Вторая версия ведёт к тюркским корням: «хах» или «ках» в ряде тюркских языков — это «твёрдый», «крепкий», а также «драгоценный камень». В таком случае прозвище могло относиться к человеку с несгибаемым характером или, иносказательно, к тому, кто «дорог» для семьи.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей сын?» — Хахонов). Фамилия недвусмысленно русская по форме, но её основа могла быть как славянской (прозвищной), так и заимствованной. Географически Хахоновы встречаются в основном в южных областях России — в Ростовской и Волгоградской областях, на Ставрополье, что косвенно поддерживает версию о тюркском следе: эти края веками соседствовали с тюркоязычными народами.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» отдельного разбора Хахонова нет, но модель «прозвище + -ов» описана как одна из самых распространённых. Исследователь А. Суперанская в работах по антропонимике не раз отмечала, что фамилии с корнем «хах-» (Хахалёв, Хахин, Хахонов) стоят на границе между исконно русскими прозвищами и заимствованиями из тюркской лексики. Спор между этими версиями не разрешён до сих пор, и каждый носитель фамилии может выбирать ту, что ему ближе.

Известных исторических деятелей с такой фамилией нет, что типично для фамилии, возникшей в крестьянской или казачьей среде. Это не делает её менее ценной: за каждым Хахоновым стоит прозвище предка, которое либо подшучивало над его любовными похождениями, либо уважительно отмечало его твёрдость.