Фамилия Харченюк образована по характерной для западных регионов модели: к основе добавили суффикс -юк. В украинской, белорусской и польской ономастике этот суффикс указывает на потомка, младшего родственника или сына. По сути, Харченюк — это «сын Харченка» или «потомок Харченко». Сама же фамилия Харченко вторична: она строится от уменьшительной формы имени Харько, а та, в свою очередь, восходит к крестильному имени Харитон (от греческого «харис» — милость, благодать). Таким образом, цепочка прозрачна: Харитон → Харько → Харченко → Харченюк.

Суффикс -юк особенно распространён на Волыни, в Полесье и на западе Украины. Если Харченко — фамилия, типичная для центральных и восточных областей, то Харченюк выдаёт человека, чьи предки жили северо-западнее, ближе к границе с Беларусью или в исторической зоне расселения украинцев на территории современной Польши. Встречается она и в Беларуси, но реже: там предпочтительнее форма Харченок.

Интересно, что в основе лежит не прямое прозвище или профессия, а имя. Это значит, что первый носитель фамилии не был связан с каким-то ремеслом или приметной чертой внешности — его просто назвали по отцу, которого в быту звали Харько. В народе имя Харитон нередко сокращалось до Харя, но в данном случае использован более благозвучный вариант Харько. Фамилия не имеет отношения к слову «харчи» или «харч» — это случайное звуковое совпадение, которое может ввести в заблуждение. Единственная версия, которую стоит рассматривать всерьёз, — происхождение от имени Харитон через цепочку уменьшительных форм.