Фамилия Харитинский — относительно редкая, и её происхождение напрямую связано с личным именем Харитон. В основе лежит каноническое греческое имя Χαρίτων (Харитон), которое переводится как «милостивый», «щедрый», «дарующий радость». В святцах почитается несколько святых с этим именем, что обеспечило ему определённую популярность в дореволюционной России.

Словообразовательная модель здесь прозрачна, но с особенностью. Суффикс -ин- в фамилиях обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Харитин. Однако в данном случае мы видим не просто Харитин, а Харитин-ск-ий. Суффикс -ск- (в варианте -ский) — типичный признак дворянских, шляхетских или, в более широком смысле, «географических» фамилий. Он отвечает на вопрос «откуда?» или «из каких?». Сочетание «Харитин + ский» говорит о том, что фамилия образована не напрямую от имени отца, а от названия населённого пункта или владения, которое, в свою очередь, произошло от имени Харитон.

Скорее всего, предок носителя фамилии был либо владельцем, либо жителем села или деревни с названием вроде Харитино, Харитинская, Харитинский хутор. Такие топонимы встречаются в центральных областях России и на севере (Вологодская, Архангельская, Костромская области). В этом случае фамилия закрепилась за человеком как указание на его «местовую» принадлежность: «он из Харитина». Альтернативная, менее вероятная версия — что фамилию дали в духовной семинарии. Семинаристам нередко придумывали «благозвучные» фамилии от имён святых с добавлением суффикса -ский. Однако для этого случая более естественной была бы форма Харитоновский или Харитонский, а не Харитинский.

Таким образом, фамилия Харитинский — это «географическая» фамилия, образованная от названия поселения, основанного человеком по имени Харитон. Носители этой фамилии не были напрямую «детьми Харитона» (как Харитоновы), а происходили из определённой местности, связанной с этим именем.