Фамилия Харитончиков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Харитончиков послужило церковное имя Харитон. Имя Харитончик представляет собой производную форму имени Харитон. Оно в переводе с греческого языка означает «благодатный, радостный». Одним из покровителей этого имени считается преподобный Харитон Исповедник. Он был родом из Малой Азии из города Икония, где пострадал от гонения на христиан при императоре Аврелиане. Получив свободу, Харитон отправился в паломничество в Иерусалим. Там он был схвачен разбойниками, которые отвели его в пещеру. От смерти святого спасла змея, отравившая своим ядом сосуд с вином, из которого пили преступники. Харитон остался жить в этой пещере, устроил в ней церковь. Вскоре у него появились последователи и в том месте образовалась Фаранская лавра, ставшая первой монашеской обителью в Иудейской пустыни. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Харитончик, со временем получил фамилию Харитончиков. О точном месте и времени возникновения фамилии Харитончиков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Харитончиков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.