Имя Харуня представляет собой просторечный вариант имени Харитон. В переводе с греческого это имя означает «благодатный, радостный». По другой версии, имя Харуня представляет собой просторечный вариант древнееврейско-арабского имени Харун, которое переводится как «горный». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Харуня, со временем получил фамилию Харунин.