Фамилия Харунжая — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение не лежит на поверхности. Первое, что бросается в глаза, — окончание «-ая», типичное для русских фамилий, образованных от прилагательных (ср. Толстая, Кудрявая). Однако основа «Харунж» звучит не по-русски, и это подсказывает путь: перед нами, скорее всего, фамилия украинского или южнорусского происхождения, адаптированная под русскую грамматическую форму.

Корень «Харунж-» восходит к украинскому слову «харунжий» — так называли знаменосца в казацком войске. Это воинское звание, примерно соответствующее прапорщику или хорунжему в польской и русской традициях (от польск. chorąży — «знаменосец»). В Запорожской Сечи и Гетманщине харунжий был уважаемой фигурой: он нёс полковое знамя и отвечал за его сохранность. Таким образом, фамилия Харунжая — это патронимическое прозвище, закрепившееся за потомками человека, который когда-то служил харунжим.

Словообразовательная модель здесь двойная. С одной стороны, суффикс «-ий» в украинском языке дал форму «Харунжий» (ср. Коваль — Ковальчук, но и просто Ковальский). С другой стороны, при переносе в русскую среду фамилию «переоформили» по типу прилагательных женского рода на «-ая», что характерно для южнорусских говоров, где часто путали родовые окончания. Встречается и вариант Харунжий, но Харунжая — более редкая и локальная форма, возможная, если фамилия закрепилась за женщиной-родоначальницей или если её просто «обрусили» при записи в метриках.

Географически фамилия тяготеет к регионам бывшего Дикого поля — современным Сумской, Полтавской, Харьковской областям Украины, а также к югу России (Кубань, Ростовская область), куда переселялись казаки. В дореволюционных списках она почти не встречается — это говорит о её позднем закреплении и малочисленности рода. Сословно предки, скорее всего, относились к казачеству или крестьянам, но с военной «изюминкой» в родословной.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает версию. Хорунжий и Хорунженко — более частые варианты, они прямо указывают на звание. Харунжая — фонетический диалектизм: в украинских говорах «о» могло переходить в «а» (харунжий вместо хорунжий). Эта деталь — главная ценность для этимолога: она привязывает фамилию к конкретному говору и узкому ареалу. Если вы носите фамилию Харунжая, ваши предки, вероятно, были не просто казаками, а знаменосцами — людьми, нёсшими честь полка.