Фамилия Хатковских — яркий пример севернорусской модели фамилий на -их/-ых. В отличие от более распространённых фамилий на -ов или -ин, которые указывают на принадлежность конкретному лицу («чей сын?»), форма на -их закрепляет за семьёй прозвище или топоним во множественном числе родительного падежа: «из дома Хатковых». Такие фамилии типичны для Вологодской, Архангельской, Вятской губерний и Сибири, куда переселенцы принесли эту традицию.

Основа фамилии — Хатковский или Хатковской. В свою очередь, она образована от прозвища или имени Хатко. Что стоит за этим корнем — вопрос, требующий разбора. Самое вероятное: диалектное слово «хатка» (уменьшительное от «хата»). В северных и центральных говорах «хата» могла означать не только дом, но и землянку, временное жильё, а «хатка» — небольшой домик. Тогда прозвище Хатко мог получить человек, живший в маленькой избе, либо строитель таких жилищ. Менее вероятна связь с тюркским «хат» (письмо, грамота) — для северных регионов это нетипично.

Суффикс -овск- в основе Хатковский указывает на вторичное образование: сначала возникло прозвище Хатко, от него — притяжательное прилагательное Хатков (чей?), а затем — топонимическая фамилия на -ский, характерная для польской и украинской традиции, но встречающаяся и у русских дворян и духовенства. Однако в сочетании с окончанием -их мы видим народную, крестьянскую форму: Хатковских — это не «дворяне из Хаткова», а «семья Хатковых» в родительном падеже, застывшая в фамилии.

Таким образом, предки современных Хатковских — скорее всего, крестьяне или посадские люди из северных областей России. Фамилия фиксирует их родовое прозвище по месту жительства или роду занятий, а окончание -их выдаёт региональную принадлежность. Встречается она редко, что типично для фамилий этой модели — они не получили всероссийского распространения, оставаясь локальными.