Фамилия Хайкин в большинстве случаев восходит к женскому имени Хайка — так в быту называли обладательниц нескольких еврейских имён. Среди них Хая, что в переводе с иврита означает «жизнь», а также Хаим и Анна (Ханна), которую в библейской традиции почитают как мать пророка Самуила. Именно от этой уменьшительной формы и пошла фамилия: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть Хайкин буквально значит «сын (или потомок) Хайки».

Здесь кроется любопытная особенность еврейской ономастики: доля фамилий, образованных от матронимов, то есть женских имён, в ней чрезвычайно велика. Объясняется это особой ролью матери в еврейском законе и традиции: происхождение и национальность ребёнка определяются по материнской линии, а потому и память о женщине-родоначальнице нередко закреплялась в фамилии. Для сравнения: в русской среде фамилии от женских имён появлялись крайне редко, обычно в ситуациях, когда ребёнка воспитывала одна мать, часто вдова, и это обстоятельство становилось определяющим для идентификации семьи.

Среди носителей фамилии немало людей, оставивших заметный след в науке и культуре. Семён Эммануилович Хайкин (1901–1968) — физик, стоявший у истоков экспериментальной радиоастрономии в СССР. Моисей Семёнович Хайкин (род. 1921) — также физик, член-корреспондент РАН. Борис Эммануилович Хайкин (1904–1978) — дирижёр, народный артист СССР. Так что за фамилией, образованной от простого женского имени, стоит и глубокая традиция, и вполне осязаемый след в истории.