Фамилия Хлыпов — редкий случай, когда прозвище почти наверняка перешло в фамилию напрямую, без промежуточного крестильного имени. Её основа — «хлып», слово, которое в русских говорах имело яркую и нелестную окраску. В словарях Даля и областной лексике «хлып» — это длинный, неуклюжий, нескладный человек, часто верзила или простофиля. Прозвище давали за внешность или манеру поведения: высокому, но неповоротливому парню, который выделялся на фоне остальных не столько силой, сколько неловкостью.

Суффикс -ов указывает на стандартную модель русских фамилий, образованных от прозвищ или мирских имён. По сути, это притяжательное прилагательное: «чей сын?» — Хлыпов, то есть сын (или потомок) человека по прозвищу Хлып. В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образуются от основ на -а/-я, здесь форма на -ов типична для мужских прозвищ с твёрдой согласной на конце.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России. Встречается в Вологодской, Архангельской и Кировской областях, где диалектное слово «хлып» было особенно употребительно. В южных говорах его почти не знали, поэтому там Хлыповы — редкость. Есть и другая, менее вероятная версия: связь с глаголом «хлыпать» (в некоторых говорах — хлюпать, чавкать, идти по грязи). Тогда прозвище могло относиться к неопрятному или медлительному человеку.

Среди однокоренных фамилий — Хлыпин, Хлыпкин, Хлыповский. Но Хлыпов выделяется лаконичностью: это чистый пример того, как односложное прозвище, не украшенное дополнительными суффиксами, стало родовым именем. Сословной принадлежности у фамилии нет — её могли носить и крестьяне, и мещане, и духовенство, но чаще всего она встречалась именно в крестьянской среде Русского Севера.