Фамилия Хлыстунов — это русская фамилия, в основе которой лежит личное прозвище или мирское имя Хлыстун. Она образована по стандартной для восточнославянского именования модели: к основе, оканчивающейся на твердый согласный, добавили притяжательный суффикс -ов, который указывает на принадлежность роду. То есть Хлыстунов буквально означает «сын Хлыстуна», «наследник Хлыстуна». Такая словообразовательная схема с суффиксом -ов — самая массовая в русских фамилиях, что говорит о древности и широкой распространенности самого имени-первоосновы.

Что касается значения, здесь есть две основные версии, и обе имеют право на жизнь. Согласно первой, Хлыстун — это мирское имя, которое давали ребенку с обережной целью. В ряде русских диалектов слово «хлыстун» означало «тупица, тунеядец». Называя так младенца, родители, как это часто практиковалось в старину, желали обратного: чтобы сын вырос смышленым, работящим и прилежным. Считалось, что злые духи не позарятся на ребенка с «плохим» именем и не будут ему досаждать.

Вторая версия связывает прозвище Хлыстун с глаголом «хлестать» — то есть «стегать, сечь, бить прутиком или кнутом». В этом случае прозвище указывало на род деятельности предка. Хлыстуном могли называть того, кто управлял лошадьми, работал кучером или ямщиком, либо мастера, который плел кнуты и арапники. Также не исключено, что прозвище носило шутливый оттенок и закреплялось за человеком бойким, резким в движениях или, напротив, болтливым, «бьющим языком».

Вторая версия выглядит более правдоподобной с точки зрения логики народных прозвищ: они чаще отражали реальные черты характера или профессию, чем становились результатом сложных родительских оберегов. Однако и первая гипотеза не единична — в русской ономастике известно немало фамилий от «предохранительных» имен.

О точном месте и времени возникновения фамилии Хлыстунов говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, с XV по XVII век, и шел неравномерно в разных землях. Судя по диалектному характеру основы, фамилия скорее всего зародилась в северных или центральных губерниях России, где слово «хлыстун» бытовало в живой речи. Стоит добавить, что в написании фамилия устойчива: форма Хлыстуновы — это множественное число, обозначающее весь род, и она используется в обиходе как семейное имя.