Фамилия Хмурин — один из тех случаев, когда прозвище предка почти не требует расшифровки. Основа здесь прозрачна: «хмура» или «хмурый». В старину так говорили о человеке угрюмого, невеселого нрава, либо о том, кто постоянно ходил с нахмуренным лицом. В говорах слово могло иметь и более узкое значение — «пасмурный», «задумчивый», поэтому прозвище не всегда означало злость или недружелюбие, скорее, внешнюю серьёзность или меланхолию.

Фамилия образована по древнейшей и самой распространённой в русском ономастиконе модели — с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывал на принадлежность: Хмурин — это «сын Хмуры» или «человек из рода Хмуры». Такая форма типична для фамилий, образованных от основ на -а/-я, в отличие от фамилий на -ов, которые крепились к основам на твёрдый согласный.

Интересно, что у фамилии есть «двойник» — Хмуров. Обе фамилии восходят к одному корню, но Хмуров, вероятно, появился от полной формы прилагательного «хмурый» (без редукции окончания), а Хмурин — напрямую от краткого прозвища Хмура. Встречаются обе фамилии в основном на северо-западе России и в Поволжье, где слово «хмура» бытовало активнее. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования разбираются в ряду прозвищ, описывающих характер.

Версия о связи фамилии с географическим названием маловероятна: топонимов «Хмурино» или «Хмура» в доступных источниках почти нет. Не стоит искать в основе древнее тюркское или финно-угорское влияние — в данном случае корень исконно славянский, общеупотребительный. Носитель фамилии может быть уверен: его предок получил прозвище за характер, и оно не таит в себе загадки.