Фамилия Ходаковы принадлежит к древнему пласту русских фамилий, образованных от личного прозвища. В её основе лежит слово «ходок», и здесь открывается целый веер значений, которые могли дать прозвище предку. Владимир Даль в своём словаре фиксирует несколько смыслов: это и человек, неутомимый в ходьбе, и пеший гонец, рассыльный, и даже нищий, промышляющий хождением по миру, а также волокита. Какое из этих значений легло в основу прозвища конкретного человека, теперь уже не установить, но каждое из них по-своему рисует портрет возможного родоначальника.

Впрочем, есть и вторая, менее очевидная версия происхождения. Исследователи допускают, что в основе фамилии может лежать не нарицательное, а личное имя. Речь идёт о краткой форме крестильного имени Фаддей, которое в народной традиции видоизменялось в цепочку Хадей — Хадок — Ходок. Само имя Фаддей восходит к греческому слову со значением «достойный похвалы». Если придерживаться этой версии, то фамилия Ходаков — это не прозвище, а отчество, отвечающее на вопрос «чей сын?»: сын Ходака, то есть потомок человека по имени Ходок.

Интересна и сама словообразовательная модель. Суффикс -ов указывает на принадлежность, и фамилия Ходаков буквально означает «сын Ходака». Такая модель была одной из самых продуктивных в русском языке, особенно в среде крестьянства и служилых людей, окончательно закрепившись в качестве наследственного именования к XVII—XVIII векам. Родственные фамилии — Ходоков, Ходаковский — встречаются реже, но указывают на ту же основу.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования фамилий растянулся на столетия и шёл неравномерно в разных землях. Ясно одно: фамилия Ходаковы — это не просто ярлык для идентификации, а замечательный памятник славянской письменности и культуры, сохранивший в себе отголосок живого народного языка, где слово «ходок» было ёмким и многозначным.