Фамилия Ходоева — женская форма фамилии Ходоев, и её происхождение стоит искать в мужском варианте. Основа фамилии — «Ходой» или «Ходо», что сразу отсылает нас к тюркским корням. В русских говорах и в контактных зонах с тюркскими народами слово «ходжа» (или «ходзя») означало «хозяин», «господин», «наставник», а также «паломник, совершивший хадж». Фамилии Ходоев, Ходжаев, Ходжиев — одного корня, и их носителями часто становились люди, чьи предки были уважаемыми старейшинами, купцами или духовными лицами.

Суффикс «-ев» указывает на принадлежность: Ходоев — буквально «сын Ходоя» или «из семьи Ходоя». В русской ономастике этот суффистр типичен для фамилий, образованных от прозвищ или имен, оканчивающихся на твердый согласный, но в данном случае исходная форма могла звучать как «Ходой» (с конечным «й»), что и дало вариант «Ходоев» через смягчение. Фамилия редкая и имеет четкую географическую привязку: по данным современных справочников, Ходоевы встречаются преимущественно в Поволжье и на Северном Кавказе, особенно среди татар, башкир и осетин. Это подтверждает версию о тюркском или иранском происхождении основы.

Интересная деталь: в осетинском языке «хъод» (с придыханием) означает «добрый», «благой», и не исключено, что в отдельных случаях фамилия могла возникнуть независимо от тюркского корня — как прозвище доброго или гостеприимного человека. Однако для большинства носителей версия с «ходжой» остается основной. Социальный контекст: предки Ходоевых, скорее всего, не были крестьянами в привычном смысле — фамилия указывает на уважаемый статус, возможно, на купечество или духовенство. В дореволюционных записях фамилия почти не встречается за пределами мусульманских общин, что тоже говорит в пользу её восточного происхождения.