Фамилия Ходунько — яркий пример того, как украинская модель образования фамилий «законсервировала» древнее прозвище. В её основе лежит глагол «ходити» (ходить), а суффикс -к-о (с ударением на последний слог) указывает на происхождение с территории современной Украины или юга России. В украинской ономастике суффикс -енк-о самый частый, но -уньк-о встречается реже и придаёт слову оттенок уменьшительности или пренебрежения.

Прозвище Ходунь, от которого пошла фамилия, могли дать человеку с характерной походкой — быстрой, тяжёлой, прихрамывающей или раскачивающейся. В говорах слово «ходун» имело и другое значение: так называли неусидчивого, непоседливого человека, который постоянно в движении. В польском языке есть схожее chodun — «ходок, пешеход», что подтверждает западнославянские корни модели. Таким образом, первый носитель фамилии был либо узнаваем по походке, либо отличался беспокойным нравом.

Фамилия бытует в основном в Черкасской, Полтавской и Сумской областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев в Краснодарском крае и на Дону. В дореволюционных ревизских сказках Ходунько встречаются в среде казаков и государственных крестьян — сословий, где прозвища нередко закреплялись как фамилии без участия священника.

Интересно сравнить Ходунько с однокоренными Ходунков, Ходунов, Ходун. Фамилия на -унько стоит особняком: она образована не от имени, а от глагольной основы, и её суффикс характерен для прозвищ, а не для патронимов. Если Ходунков — это «сын Ходуна» (русская модель), то Ходунько — это сам Ходунь, только с украинским уменьшительным суффиксом, который со временем стал фамильным.

Споров о происхождении фамилии почти нет: корень прозрачный, а суффикс типичен для украинской антропонимии. Единственное, что стоит уточнить: ударение в фамилии падает на последний слог (Ходунько́), что отличает её от русских фамилий на -ов, где ударение часто подвижное. Эта простая фонетическая черта — верный маркер украинского происхождения.