Фамилия Хохлаткина образована от прозвища или нецерковного имени Хохлатка. В основе — прилагательное «хохлатый», то есть имеющий хохол, пучок торчащих волос или перьев. Прозвище могло относиться к человеку с необычной, взлохмаченной прической, либо к тому, кто носил шапку или головной убор с характерным верхом. В русских говорах «хохлаткой» называли также курицу определённой породы — с хохолком на голове, так что прозвище иногда давали за внешнее сходство с этой птицей или за манеру поведения.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Хохлаткин — «сын Хохлатки» или «человек из семьи Хохлатки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я. Женская форма Хохлаткина — это не отдельная фамилия, а грамматическое изменение по роду, закрепившееся в документах за женщинами той же семьи.

Фамилия редкая, и её география неширокая. Судя по доступным данным переписей и метрических книг, основное бытование — центральные и северные губернии России, в частности Вологодская и Костромская области. В этих краях слово «хохлатка» было в ходу как название птицы и как прозвище, что подтверждает неслучайность появления фамилии именно там.

Интересная деталь: в отличие от фамилии Хохлов, которая восходит к этнониму (украинец) и широко распространена, Хохлаткина имеет чисто описательное, бытовое происхождение. Её носители — не потомки южан, а, скорее всего, крестьяне или ремесленники Русского Севера, получившие прозвище за внешность. Фамилия не дворянская и не купеческая, что типично для прозвищных образований на -ин: они чаще всего возникали в простонародной среде и фиксировались в писцовых книгах за крестьянами и посадскими людьми.

Других версий, кроме прозвищной, у этой фамилии нет. Связь с растением хохлаткой (лесной травой) маловероятна: прозвища от названий растений обычно давались по другому принципу и редко образовывали фамилии на -ин. Так что основная и единственная правдоподобная гипотеза — прозвище по внешнему признаку, закрепившееся в роду.