Фамилия Хомушкин звучит как тюркская или кавказская, но в действительности она вписана в классическую русскую модель на -ин. Этот суффикс в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Хомушкин, то есть сын или потомок Хомушки. Значит, в основе лежит некалендарное прозвище или имя Хомушка.

Корень «хомуш-» почти наверняка восходит к тюркскому «комуш» или «камыш» — в русской передаче «хомуш» могло означать камыш, тростник. В диалектах южнорусских и казачьих областей «хомуш» — это заросли камыша или болотистое место. Прозвище Хомушка могли дать человеку, жившему у камышовых плавней, либо тому, кто был высоким и худым, как тростник. Есть и более прозаичная версия: «хомуш» в ряде говоров означало закуток, клетушку для скота, а Хомушкой называли домоседа или хозяина, который всё время при деле.

С географией у фамилии всё прозрачно. Хомушкины встречаются в Волгоградской, Ростовской областях и в Ставрополье — именно там, где много камыша и где тюркские заимствования плотно вошли в местные говоры. Встречаются единичные случаи в центральной России, но это скорее результат поздних миграций.

Словообразовательная модель проста: тюркская основа «хомуш» + русский уменьшительный суффикс -к- (он даёт значение «маленький, свой, близкий») + фамильный -ин. Фамилия недворянская, крестьянская или казачья. В списках однодворцев и казаков юга России такие фамилии на -ин — обычное дело.

Редкость фамилии в том, что она не получила распространения через церковные имена: ни Хома, ни Фома здесь не при чём. Чисто прозвищная, ландшафтная фамилия, которая прямо указывает на место обитания предка — у камыша, в сырой низине. Если ваш предок был Хомушкин, он, скорее всего, жил на юге, в пойме реки, и занимался земледелием или рыболовством.