Фамилия Хомутцова — редкий случай, когда написание говорит о происхождении больше, чем корень. На первый взгляд основа ясна: «хомут» — часть конской упряжи, деталь, без которой не обходился ни один крестьянин, ни один извозчик. Но суффикс -ц- вносит важный нюанс.

В русской ономастике фамилии на -ов/-ев образуются от имени или прозвища отца. Если бы предка звали Хомут, его сын стал бы Хомутовым. Фамилия Хомутцов указывает на иную модель: в её основе лежит не прозвище Хомут, а прозвище Хомутец. Так могли называть человека маленького роста, щуплого, либо того, кто работал с небольшими хомутами — например, мастера, делавшего упряжь для пони или телег облегчённого типа. Суффикс -ец в прозвищах часто имел уменьшительное или уничижительное значение: Хомутец — «маленький хомут» или «человек, похожий на хомут». Соответственно, Хомутцов — это «сын Хомутца».

Вероятность того, что фамилия связана с географическим названием, мала: в русской топонимике нет известных селений Хомутцы или Хомутец, которые дали бы такую фамилию. Зато по говорам встречается слово «хомутца» — так в некоторых регионах называли хомутную подушку, войлочную прокладку под хомут. Если предок торговал или шил такие подушки, прозвище Хомутец закреплялось за ним по ремеслу.

Фамилия однозначно русская, с типичным «вотчинным» суффиксом -ов, указывающим на принадлежность. Женская форма Хомутцова — естественное склонение по падежам; в мужском роде фамилия звучала бы Хомутцов. Встречаемость фамилии крайне низкая: основные носители зафиксированы в центральных областях России и на Урале, что косвенно подтверждает её крестьянское или ремесленное происхождение. Дворянских родов с такой фамилией не известно — в родословных книгах её нет.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает версию: Хомутов — самая распространённая, от прямого прозвища; Хомутников — от названия профессии (хомутник — мастер по хомутам); Хомутцова — самая редкая, сохранившая в основе именно уменьшительную форму прозвища. Эта деталь и делает фамилию ценной для историка: она указывает не на занятие, а на личную характеристику конкретного человека, которого в деревне звали Хомутцом.