Фамилия Хрисанфова образована от мужского крестильного имени Хрисанф, которое в переводе с древнегреческого означает «златоцветный» (от слов «хрисос» — золото и «антос» — цветок). Это имя всегда оставалось редким: в святцах оно встречается, но массового распространения на Руси не получило, а к началу XX века практически вышло из употребления. Поэтому и фамилия, от него произведённая, встречается нечасто и сразу выделяется на фоне более привычных Ивановых или Петровых.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: к основе Хрисанф- добавили типичный для русских фамилий суффикс -ов, а затем родовое окончание -а. Такую форму получили фамилии жён и детей в семьях, где главу рода звали Хрисанф. По сути, Хрисанфова — это ответ на вопрос «чьи вы будете?»: люди, принадлежащие потомкам человека по имени Хрисанф.

Имя восходит к раннехристианским временам. Одним из его покровителей считается мученик Хрисанф Филиппопольский, день памяти которого приходится на 2 сентября. Само имя носили преимущественно люди книжные либо выходцы из духовного сословия: редкое греческое имя с красивым значением чаще давали при постриге или в семьях, где следили за церковным календарём и хотели подчеркнуть образованность. Скорее всего, основатель рода Хрисанфовых обладал высоким социальным статусом — крестьяне в массе своей предпочитали более привычные имена, а редкое имя мог позволить себе человек, связанный с церковью или городской культурой.

Интересно, что фамилия сохранила архаичное написание с буквой «ф» в середине, тогда как в разговорной речи имя нередко упрощали до Крисанф или даже Кирсан. От этих просторечных форм пошли отдельные фамилии — Крисанфов, Кирсанов, которые звучат привычнее. Хрисанфова же осталась ближе к книжному, церковному произношению, и это делает её своеобразным маркером: по написанию можно предположить, что предки носителя фамилии были людьми грамотными и, вероятно, имели отношение к приходской среде.