Фамилия Хрюнова — женская форма фамилии Хрюнов, которая образована от прозвища или мирского имени Хрюн. В русской ономастике эта фамилия стоит в ряду «звериных» и «птичьих» прозвищ, но с оговоркой: в отличие от фамилий Волков, Соколов или Зайцев, основа здесь не животное, а звукоподражательное слово.

Самая очевидная версия — связь со словом «хрюкать», то есть издавать звук, характерный для свиньи. Прозвище Хрюн могли дать человеку с хриплым, низким голосом, похожим на хрюканье, либо тому, кто разводил свиней, пас их или торговал ими. В крестьянской среде такое прозвище не было оскорбительным — скорее бытовым, описательным. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна подобные образования рассматриваются как типичные для «животного» пласта, хотя сам корень «хрю-» встречается реже, чем «волк» или «медведь».

Менее вероятная, но возможная версия — от слова «хрюн» в значении «хмурый, угрюмый человек». В некоторых говорах, особенно на юге России, «хрюнить» означало «ворчать, брюзжать». Тогда прозвище Хрюн закреплялось за человеком с тяжёлым характером. Эта гипотеза слабее, потому что не подкреплена массовой фиксацией в письменных источниках, но полностью исключать её нельзя.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Хрюнов — сын Хрюна. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская. Встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, но точной географической привязки нет — фамилия редкая, в переписях XVIII–XIX веков почти не попадается. Среди однокоренных можно назвать Хрюкин, Хрюков, Хрюкалов — все они образованы от той же звукоподражательной основы и тоже редки.

Сегодня фамилия Хрюнова — один из примеров, как бытовое прозвище, основанное на звуке, закрепилось в русском фамильном фонде. Никаких известных исторических деятелей с этой фамилией нет, а её носители — обычные люди, чьи предки когда-то получили меткое прозвище по голосу или занятию.