Фамилия Худаков происходит от прозвища Худак, и чтобы понять её смысл, нужно разобраться, что вкладывали в это слово наши предки. В старинных диалектах «худак» означало «бедный человек, нищий». Об этом напоминает и поговорка, сохранившаяся с тех времен: «Богатырь (богач) дивится, чем худак живится». Казалось бы, прозвище прямо указывало на социальный статус или материальное положение — так могли назвать человека небогатого, живущего в нужде.

Но здесь кроется второй, более интересный пласт значения. Прозвище Худак могло выполнять «охранительную» функцию и служить оберегом. В народе верили, что имя или прозвище с «плохим» смыслом отпугнет злых духов и не сглазит ребенка. Надеясь вырастить красивого и здорового мальчика, родители нарочно называли его Худаком — чтобы настоящая худоба и болезни обошли стороной. Такой обычай был широко распространен, и в этом случае прозвище не отражало реального положения дел, а было своеобразным пожеланием-оберегом.

Суффикс -ов в фамилии указывает на принадлежность: Худаков — сын Худака, потомок человека с таким прозвищем. Модель образования типична для русских фамилий, сложившихся из прозвищ в XV–XVII веках. Интересно, что у фамилии есть «родственники» по корню: Худяков, Худов, Худин. При этом Худаков и Худяков не всегда различали на письме, поскольку в говорах акающих регионов безударные «а» и «я» звучали почти одинаково. Поэтому часть семей, которые сейчас пишутся как Худяковы, могли изначально быть Худаковыми и наоборот.

Какую из двух версий — про бедность или про оберег — считать основной? Скорее всего, обе имели право на существование в разных случаях. Если прозвище давали взрослому человеку, оно чаще отражало его достаток. Если же имя прикреплялось к ребенку при рождении, вероятнее срабатывал магический принцип защиты. Точную историю конкретной семьи без генеалогических изысканий не восстановить, но оба пути ведут к одному корню — слову «худой» в значении «тощий, слабый, бедный».