Фамилия Худайбердиев напрямую отвечает на вопрос, который читатель задаёт в первую очередь: её основа — мужское имя Худайберди, а сама фамилия означает «сын (или потомок) Худайберди». Имя составное, и в нём два пласта: «худай» — это Бог, Всевышний в персидском и тюркских языках, а «берди» — тюркская форма глагола «дать» (буквально «дал»). Вместе получается «Аллах дал» или «Богом данный».

Такое имя давали не случайно. В традиционной культуре многих мусульманских народов Поволжья, Средней Азии и Кавказа имя Худайберди получал мальчик, рождённый после долгих молитв и специальных обрядов, — выпрошенный у Всевышнего. Считалось, что имя-оберег закрепляет божественный дар и защищает ребёнка. Это же значение — «данный Богом» — встречается у разных народов в самых разных формах: славянские Богдан и Фёдор (от греческого Теодор), библейский Матфей, арабское Атаулла. Так что фамилия Худайбердиев встроена в широкий ряд имён-благодарностей, только у неё своя, восточная огласовка.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: к имени Худайберди добавили русский патронимический суффикс -ев (после мягкого согласного «д»), который указывает на принадлежность роду. Так в XIX — начале XX века, когда у тюркских и кавказских народов начали массово закрепляться фамилии по отцу, из имени отца и возникла фамилия Худайбердиев. Первым её носителем, скорее всего, был человек по имени Худайберди, а уже его дети и внуки стали писаться Худайбердиевыми.

Географически фамилия встречается там, где распространены тюркские языки и ислам: у татар и башкир, у народов Дагестана, у узбеков и туркмен. При этом написание может слегка отличаться: Худайбердиев, Худайбердыев, Худайбергенов (с заменой «ди» на «ген» — «дал» в некоторых тюркских диалектах). Это не разные фамилии, а варианты одного имени в разных языковых средах.

Отдельного внимания заслуживает то, что имя Худайберди нередко путают с похожим по звучанию Худайкул или Худайназар. Но если разобрать по частям, разница очевидна: «берди» — это именно «дал», а не «раб» или «помощник». Поэтому фамилию Худайбердиев можно считать одной из самых «говорящих»: она буквально рассказывает историю о долгожданном, вымоленном ребёнке, который стал родоначальником целого рода.