Фамилия Хухрий — редкая, но говорящая. Она образована не от крестильного имени, а от прозвища или мирского имени. В её основе лежит древний славянский корень «хух-», который в диалектах означал нечто худое, тощее, хилое, а также — что любопытно — человека с простуженным, хриплым голосом. В словаре Даля зафиксирован глагол «хухрить» — кашлять, хрипеть, кряхтеть. Таким образом, Хухрий — это тот, кто «хухрит», то есть либо болезненный, слабый, либо обладающий характерной хрипотцой в голосе.

Фамилия имеет украинскую или южнорусскую словообразовательную модель. Суффикс -ий (в исходной форме Хухрий) характерен для украинских фамилий, образованных от прозвищ с помощью усечения и добавления этого окончания. Сравните: Гнилий, Кривий, Сухий. В русском языке аналогом был бы суффикс -ой (Хухрой), но в украинской традиции закрепилась форма на -ий. Это указывает на то, что предки носителя фамилии с высокой вероятностью происходили с территории современной Украины или южных областей России, где такие фамилии были обычны.

Встречается два варианта написания: Хухрий и Хухрый. Первый — более архаичный, отражающий украинское произношение. Второй — результат обрусения, когда окончание привели в соответствие с русскими фамилиями на -ый. В XVIII–XIX веках, при переписях и паспортизации, писарь мог записать фамилию на слух, поэтому оба варианта имеют право на существование.

По социальному происхождению фамилия Хухрий — крестьянская или казачья. Она не встречается среди дворянских родов. Носители, скорее всего, были вольными или частновладельческими крестьянами, а на юге — казаками. Прозвище могло закрепиться за человеком с заметной внешностью или манерой говорить, и со временем стало наследственным именем всего рода. Сейчас фамилия крайне редка, её можно встретить в основном в Запорожской, Харьковской областях Украины и у потомков переселенцев в Краснодарском крае.