Фамилия Кикирев — один из тех случаев, когда за основой фамилии стоит не личное имя и не профессия, а географическое название. Прозвище Кикир, от которого образована фамилия, восходит к топониму Кикирей. Таких мест на карте России как минимум два, и оба могли дать начало фамилии.

Первая версия ведет в Ленинградскую область. Недалеко от Санкт-Петербурга есть местечко Кикирей. Название это, скорее всего, финского происхождения: от Kikirei-kino, что переводится как «лягушечье болото». Если родоначальник Кикиревых был уроженцем этих мест, прозвище Кикир закрепилось за ним по месту жительства. Вторая версия отсылает в Сибирь, в Кемеровскую область, где протекает ручей Кикирей. Здесь корни уже бурятские: слово кикирей означает «ворчать, рычать, урчать». Так могли прозвать человека с громким голосом или суровым нравом, либо опять же переселенца с берегов этого ручья.

Модель образования фамилии проста и прозрачна: к основе Кикир прибавился типичный русский суффикс принадлежности -ев. Вопрос «чей?» — Кикирев, то есть сын или потомок человека по прозвищу Кикир. Окончание -ев, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий или шипящий согласный, что и произошло после утраты конечного -ей в прозвище.

Фамилия редкая. В старых боярских или дворянских списках она не встречается — скорее всего, это поздняя крестьянская или мещанская фамилия, закрепившаяся в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии по месту выхода.