Фамилия Киковы (в мужском варианте — Киков) образована от личного прозвища, и это один из самых распространённых способов появления русских фамилий. В основе лежит прозвище Кик, и тут есть как минимум две версии его происхождения, обе неочевидные.

Первая версия отсылает к глаголу «кикать» — «кричать (о птице)». Казалось бы, логично предположить, что прозвище дали крикливому человеку, но в народной традиции за этим стояло другое. Киком могли назвать вдову или очень несчастного, обездоленного, больного человека — то есть того, чей «крик» был не от скандального характера, а от горя.

Вторая гипотеза связывает прозвище со словом «кика» — старинным головным убором замужней женщины. В южных областях России кика представляла собой высокий колпак из проклеенного холста, который сверху покрывали «сорокой». Если прозвище Кика (а фамилия образована от формы Кик) дали ребёнку, то, скорее всего, он рос без отца, и его воспитывала одна мать. Прозвище в таком случае указывало на неполную семью и социальное положение.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Киков — это сын или потомок человека по прозвищу Кик. Такая модель была типична для основной массы русского населения, а не только для знати.

Точное место и время возникновения фамилии Киковы установить сложно. Процесс закрепления фамилий шёл несколько столетий, и подобные прозвищные фамилии могли появиться и в XVI, и в XIX веке в разных регионах. Стоит обратить внимание, что фамилия встречается не только у русских, но и у осетин, где Киков — распространённая фамилия, образованная от имени Кик (краткая форма от мужских имён, например, Казбек). Это делает фамилию неоднородной по происхождению: в русском контексте она связана с прозвищем, в осетинском — с личным именем.