Фамилия Кипаренко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, изначально указывавший на сына или потомка человека, чьё имя или прозвище стало основой, в XVII–XVIII веках закрепился в Левобережной и Слободской Украине как главный фамильный формант. Носители фамилии Кипаренко — потомки человека по прозвищу Кипар или Кипарь.

Сложность в том, что основа «кипар-» не имеет очевидного значения в украинском или русском языках. Здесь возможны две основные версии. Первая связывает прозвище с тюркским словом «кипа» (мера сыпучих тел, связка, тюк) или «кипарис» — деревом, которое в народе могли называть сокращённо. Маловероятно, что прозвище дали по дереву: кипарис на Украине не растёт, и такое прозвище было бы книжным. Вторая версия, более правдоподобная, — происхождение от греческой фамилии Кипарис или Кипарисис, которую могли носить выходцы из греческих поселений Приазовья или Крыма. В XVIII–XIX веках греки переселялись на земли современной Донецкой и Запорожской областей, и их фамилии нередко адаптировались под украинскую модель: Кипарис → Кипаренко (сын Кипариса).

Географически фамилия Кипаренко тяготеет к юго-востоку Украины: чаще всего она встречается в Днепропетровской, Запорожской и Харьковской областях. Это косвенно подтверждает «греческий след» — именно в этих регионах были греческие колонии. В России фамилия редка и встречается в основном в Краснодарском крае и Ростовской области, куда переселялись украинские крестьяне.

С точки зрения сословной принадлежности, Кипаренко — фамилия казацкая или крестьянская. В реестрах запорожских казаков и метрических книгах XVIII века встречаются отдельные носители, но массового распространения фамилия не получила. Её редкость — дополнительный аргумент в пользу того, что прозвище было не от распространённого ремесла или внешности, а от личного имени или фамилии конкретного переселенца.