Фамилия Кипариси звучит на русском ухе как книжная или искусственная, но у неё есть конкретное географическое и социальное дно. Её основа — греческое слово κυπαρίσσι (кипарисси), то есть «кипарис». В русском языке это дерево называли «кипарис» (мужской род), а в греческом оно среднего рода. Фамилия могла возникнуть в среде греческого духовенства или купечества, которое переселялось в Россию в XVIII—XIX веках, особенно в южные губернии (Новороссия, Крым, Приазовье). Греки, принявшие российское подданство, часто получали фамилии по названиям растений, городов или церковных праздников — и Кипариси здесь в одном ряду с Маслини, Лаври, Родоки.

Вероятнее всего, фамилия образована не от прозвища, а от названия места или монастыря. В Греции есть несколько топонимов Кипариси (например, город в Мессении), а также храмы в честь Кипариссийской иконы Божией Матери. Священник или монах, вышедший из такого места, мог получить фамилию по храму или селу. Суффикс -и (а не -ов или -ев) указывает на то, что фамилия не прошла полную русификацию — её оставили в греческой форме, как, например, фамилии Карамази, Папади, Христофори.

Встречается Кипариси и у русских дворян, но это, скорее всего, результат пожалования фамилии при крещении или за службу — в таких случаях греческие корни сознательно подчёркивали учёность или духовный сан родоначальника. В дореволюционных адрес-календарях носители фамилии фиксируются в Таврической губернии и в Одессе, среди преподавателей гимназий и врачей. Массовой фамилия не стала, осталась редкой, что подтверждает её происхождение от конкретного лица или малой группы переселенцев, а не от целого сословия.

Если ваши предки носили Кипариси, ищите их в метрических книгах греческих церквей юга России — там фамилия встречается в оригинальном написании, иногда с двойной «с» (Кипарисси). В советское время написание могли упростить до одной «с», но корень остался тем же.