Фамилия Кипарина — женская форма, но в её основе лежит мужское прозвище или нецерковное имя Кипарис, которое и дало начало родовому имени. На первый взгляд кажется, что связь с вечнозелёным деревом очевидна, но тут есть важный нюанс: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Кипарина — «дочь или жена Кипариса». Значит, предок носителя фамилии (в мужском варианте — Кипарин) сам звался Кипарисом.

Откуда взялось такое прозвище? Самая прямая версия — из семинарской среды. В XVIII–XIX веках будущим священникам в духовных училищах нередко давали «благозвучные» фамилии по названиям растений, камней, античных героев. Кипарис — символ скорби и бессмертия в христианской традиции, дерево, упоминаемое в Библии. Такую фамилию мог получить выпускник семинарии, и она закреплялась за его потомками. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия встречается в регионах, где были сильны духовные учебные заведения — например, в центральной России и на юге.

Вторая, менее очевидная, но тоже возможная версия — мирское имя Кипарис. На Руси до XVIII века были распространены «растительные» имена: Дуб, Берёза, Калина. Кипарис — южное дерево, поэтому такое имя скорее могло появиться в южных губерниях (Кубань, Черноземье) или у людей, связанных с торговлей с греками, где кипарис почитался. Однако как массовое явление это маловероятно — для крестьянского быта имя было экзотичным.

Словообразовательная модель у фамилии простая: основа Кипарис- + суффикс притяжательности -ин. Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Кипа́рина, хотя в разговорной речи иногда смещается на третий. Фамилия редкая, в рейтинге частотности не входит даже в первую тысячу. Её носители — это, вероятно, потомки священнослужителей или, реже, выходцы из южных регионов, где дерево было знакомо не понаслышке.