Фамилия Кипарис — случай почти уникальный для русской ономастики. В ней нет суффикса, который превращал бы прозвище в фамилию: ни -ов, ни -ин, ни -ский. Это так называемая «окаменелая» форма, когда слово застыло в именительном падеже. Такие фамилии в России редки и чаще всего имеют позднее происхождение — из духовного сословия или из среды городских обывателей, где фамилии присваивали искусственно.

Самая правдоподобная версия — семинарская. В духовных училищах и семинариях XVIII–XIX веков ученикам нередко давали «благозвучные» фамилии по названиям растений, камней, античных героев или библейских мест. Кипарис — дерево, многократно упомянутое в Библии (из него, по преданию, строили храм Соломона). Такую фамилию мог получить выпускник, чья прежняя, бытовая фамилия казалась начальству слишком простой или неблагозвучной. Кипарис символизировал печаль и вечность, что вполне подходило для церковной среды.

Менее вероятна, но не исключена версия прозвищная. В южных регионах России, на Украине, в Крыму и на Кавказе кипарис — дерево привычное. Прозвище Кипарис могли дать человеку высокому, стройному или, наоборот, мрачному и молчаливому. Однако в крестьянской среде такие «растительные» прозвища чаще оформлялись суффиксами (Кипарисов, Кипарисович), а без них — редкость.

Встречается фамилия и у греков, и у потомков греческих переселенцев в Приазовье. Для них Кипарис — не искусственная фамилия, а естественная, от личного имени или прозвища. В греческой ономастике слово κυπάρισσος (кипариссос) могло быть и именем, и прозвищем, и топонимом.

Социально носители фамилии Кипарис в Российской империи — это почти всегда либо священно- и церковнослужители, либо выходцы из духовного сословия, перешедшие в светские профессии. Дворянских родов с такой фамилией нет, крестьян — единицы. В советское время фамилия стала встречаться шире, но остаётся редкой. По данным переписи, в России живёт не более нескольких сотен человек с фамилией Кипарис, и почти все они — в крупных городах.

Итог: если ваш предок носил фамилию Кипарис, с большой вероятностью он учился в семинарии или был священником. Это «кабинетная» фамилия, придуманная за письменным столом, а не прозвище из крестьянского быта.