Фамилия Капарис — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а греческая. В русском языке она звучит как искусственное или очень позднее образование, и вот почему.

Корень «капар-» отсылает к греческому κάπαρης (káparis) — «каперс». Так называют колючий кустарник, чьи маринованные бутоны и плоды используются как пряность. В южных регионах Российской империи, особенно в Крыму, на черноморском побережье Кавказа и в Новороссии, греческие поселения были многочисленны. Фамилию Капарис могли дать либо выходцу из семьи, торговавшей каперсами, либо человеку, носившему прозвище за любовь к этой приправе или за сходство с растением (например, за колючий нрав или цепкость). Греческий суффикс -ис здесь выполняет роль фамильного окончания, аналогичного русскому -ов.

Менее вероятна, но возможна версия, что фамилия образована от прозвища Капарь — так в южнорусских говорах могли называть капризного, своенравного человека. Слово «каприз» в русский язык пришло через французский, но в народной этимологии его могли связать с греческим заимствованием. Тогда суффикс -ис — это уже русский патронимический суффикс в родительном падеже (чей? — Капариса), характерный для фамилий на -ин, но в редком фонетическом варианте.

Географически фамилия Капарис встречается в основном на юге России и Украины, а также среди потомков греческих переселенцев в Приазовье. В центральной России она практически не фиксируется. Это сразу указывает на её локальный, диалектный характер: носители — скорее всего, потомки греков-торговцев или ремесленников, ассимилировавшихся в XIX — начале XX века.

Словообразовательная модель проста: основа (греческое название растения или прозвище) + фамильный формант -ис. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев, Капарис не указывает на принадлежность к конкретному роду, а скорее на индивидуальную характеристику предка — его занятие, место жительства или внешнюю черту.