Фамилия Киптилий — редкая и загадочная даже для специалистов по русским фамилиям. Её происхождение неочевидно, и здесь возможны две основные версии, причём обе ведут в южнорусские или украинские земли.

Первая и самая вероятная версия связывает фамилию с украинским или южнорусским диалектным словом «киптіль» — так в некоторых регионах называли копоть, сажу, особенно на кухонной утвари. Прозвище Киптиль могли дать человеку, который вечно пачкался в саже — печнику, кузнецу, трубочисту или просто неопрятному, чумазому человеку. Суффикс -ий в данном случае (Киптил-ий) характерен для украинской модели образования фамилий от прозвищ на -іль, -аль: он указывает на принадлежность к роду, на «того самого Киптиля». Фамилия могла звучать как Киптиль, а затем получить патронимическое окончание -ий, типичное для украинских фамилий (сравните: Коваль — Ковалий, Швець — Швеций).

Вторая версия — топонимическая. На Украине есть несколько небольших населённых пунктов с похожей основой, например, село Киптилы (или Киптиловка) на Харьковщине. В этом случае фамилия Киптилий могла образоваться от названия места, где жил предок: «из Киптилов» — Киптилий. Но это менее вероятно, так как суффикс -ий чаще образует фамилии от личных прозвищ, а не от географических названий.

Что интересно: фамилия Киптилий практически не встречается в старых московских боярских списках или переписях центральной России. Её ареал — юг России и восток Украины, в частности, Курская, Белгородская, Харьковская области. Носители фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской или ремесленной среды — из тех, кто занимался печным делом, кузнечным ремеслом или просто жил в местности, где слово «киптіль» было в ходу.

Словообразовательно фамилия уникальна: в русском ономастиконе почти нет аналогов с таким корнем. Её можно спутать с греческой фамилией Киптилиди (от греческого «кипос» — сад), но это совсем другая история — греческие фамилии оканчиваются на -иди, -ади, а не на -ий. Так что Киптилий — стопроцентно восточнославянская, диалектная, очень локальная фамилия.