Фамилия Кирилюс образована от имени собственного и относится к распространенному типу балтийских фамилий. Нередко древние балтийцы к имени новорожденного присоединяли имя его отца, обозначая тем самым принадлежность к определенному роду. На это указывает окончание –юс. В основе фамилии лежит христианское мужское имя Кирилл, которое восходит к древнегреческому «kyrios» – «господин, владыка». Это были притяжательные прилагательные с суффиксами -ас, -ис, -юс, изначально указывающие на имя главы семейства.