Фамилия Кирпин происходит от прозвища Кирпа. В основе, скорее всего, лежит ярославское слово «кирпь» — пучок трепаного льна. Если так, то прозвище было профессиональным: Кирпой могли называть трепальщика льна, человека, который обрабатывал волокно. Это ремесло было распространено на севере и северо-востоке России, поэтому географически фамилия Кирпин могла закрепиться именно в тех краях.

Есть и другая версия, менее связанная с ремеслом. Слово «кирпатый» в некоторых говорах означало «курносый». Тогда прозвище Кирпа давали человеку по характерной внешности — приплюснутому носу. Обе гипотезы имеют право на жизнь, но первая (связь со льном) выглядит более конкретной и редкой, что делает её интереснее для этимологического разбора.

Сама фамилия образована по типичной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Кирпин, то есть сын или потомок Кирпы. В списках однокоренных фамилий можно встретить Кирпачёва, Кирпичёва, Кирпатого — все они восходят к той же основе, но с разными суффиксами. Фамилия Кирпин нечастая, поэтому её носители, скорее всего, происходят из одной локальной группы, где прозвище было в ходу.