Фамилия Кирсакова — женская форма фамилии Кирсаков. Основная версия происхождения лежит в основе-прозвище или мирском имени Кирсак. В русской ономастике это слово связывают с тюркским корнем «кыр» — степь, пустошь, поле. Отсюда «кырсак» могло означать «степняк», «житель открытой местности» или, по другой версии, «дикий, нелюдимый человек». В тюркских языках есть и слово «кырсак» в значении «сухой, высохший», что могло относиться к человеку худощавого телосложения или с резкими чертами лица.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: к основе Кирсак добавили патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Кирсака). Это говорит о том, что фамилия формировалась в центральных и южных регионах России, где суффикс -ов был преобладающим, а не в северных, где чаще использовали -их/-ых.

Интересная деталь: фамилия Кирсаков (и Кирсакова) встречается в документах XVI-XVII веков в среде служилых людей и казачества. Например, в писцовых книгах и разрядных записях упоминаются Кирсаковы среди детей боярских и казаков на южных рубежах Московского государства — в Рязанском крае и на Дону. Это объяснимо: именно в пограничных степных областях прозвище «Кирсак» (степняк) было вполне естественным. Таким образом, предки носительницы фамилии с высокой вероятностью были не крестьянами, а людьми военного сословия, охранявшими границу.

Встречается и редкая, но возможная версия от календарного имени Кирсак — народной формы церковного имени Кириак (от греческого «кириакос» — господний). Однако эта гипотеза менее убедительна: имя Кириак в крестьянской среде давало формы Кирьяк, Кирсан, но не Кирсак. Прозвищное, «степное» происхождение выглядит исторически более обоснованным.