Фамилия Киселенко в своей основе содержит прозвище Кисель. В XV–XVII веках это прозвище было распространено в самых разных слоях населения — от крестьян до служилых людей. В народных говорах киселём называли человека мягкого, слабохарактерного или, напротив, льстеца, который «разливается киселём» перед нужным человеком. Так что прозвище указывало на поведение, а не на внешность или род занятий.

Сама модель Киселенко — это типичная украинская фамилия, образованная с помощью патронимического суффикса -енко, который означает «сын» или «потомок». Буквально: «сын Киселя». В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые закрепились в основном у дворянства и официальных сословий, суффикс -енко долгое время оставался фамильным маркером казацкой старшины, мещан и крестьян Левобережной Украины. Поэтому географически Киселенко — фамилия по преимуществу украинская, сгусток носителей приходится на Черниговскую, Полтавскую и Сумскую области.

Прозвище Кисель со временем вытеснило исходное крестильное имя, став наследственным. В документах XVII века встречаются и прямые записи: например, в реестрах Нежинского полка упоминаются казаки с таким прозвищем. От них и пошли многочисленные Киселенко — потомки того, кого в своё время прозвали за характер киселём.