Фамилия Кишканева — женская форма фамилии Кишканев, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев, которые образованы от крестильных имён (Иванов, Петров) или профессий (Кузнецов), основа «Кишкан» требует более пристального разбора.

Словообразовательная модель здесь проста: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?» — Кишканев, то есть сын или потомок Кишкана). Само прозвище Кишкан, скорее всего, связано с диалектным словом «кишка». В говорах северных и центральных областей России «кишкой» могли назвать худого, долговязого человека — как бы «вытянутого в кишку». Вполне вероятно, что предок носителя фамилии был очень высоким и худощавым, за что и получил такое прозвище. Вторая версия, менее распространённая, отсылает к слову «кишка» в значении «внутренности» — так могли прозвать человека, занимавшегося разделкой туш или торговлей субпродуктами (кишками, требухой). Это ремесленное прозвище, которое потом закрепилось как фамилия, вполне в духе русской ономастики.

Важно отметить, что фамилия Кишканев — нечастая. Встречается она преимущественно в Поволжье и на юге России, что может указывать на локальное бытование прозвища. Сравните с однокоренными, но более редкими фамилиями Кишкин, Кишков — они образованы от той же основы, но с разными суффиксами. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования от названий частей тела или продуктов питания рассматриваются как типичные для прозвищного слоя: они описывают внешность, характер или занятие человека, а не его родословную. Таким образом, Кишканевы — это потомки либо очень худого человека, либо ремесленника, работавшего с кишками.