Фамилия Кишко звучит как типичное украинское или белорусское прозвище, застывшее в форме имени. Её окончание -о характерно для западнорусских земель, где суффикс -к- часто присоединяли к основе, а окончание -о указывало на мужское прозвище. Вопрос происхождения упирается в то, какое слово лежит в основе: «кишка» или «кiшка».

По первой версии, прозвище Кишко дали человеку с заметным животом. В старину слово «кишка» имело и переносное значение «брюхо, желудок». Полнота тогда не считалась недостатком — наоборот, она говорила о сытости и достатке хозяина. Так что прозвище могло быть уважительным или нейтрально-описательным, без насмешки.

Вторая версия связывает фамилию с украинским словом «кiшка» — кошка. Тут возможны два поворота. Первый — профессиональный: на юге и западе России Кишками называли мелких торговцев-кошкодавов. Они ездили по деревням, меняли дешёвый товар на кошек, а потом пускали шкурки на дешёвый мех. Промысел был прибыльным, но непрестижным, и прозвище закреплялось за человеком этого занятия. Второй вариант — прозвище по характеру: ласкового, льстивого, «мурлыкающего» человека тоже могли прозвать Кошкой или Кишко.

Выбрать одну версию сложно — обе лингвистически возможны. Но если смотреть на географию фамилии (она чаще встречается в западных областях Украины и Беларуси), то версия с «кiшка» выглядит чуть предпочтительнее: в тех краях слово «кишка» в значении «брюхо» было менее употребительно, чем в великорусских говорах. Как бы то ни было, фамилия Кишко — яркий пример того, как прозвище, данное по внешности, занятию или повадке, стало родовым именем.