Фамилия Кистяев образована от прозвища Кистяй. Возможно, оно этимологически связано с диалектным глаголом «кистать», то есть «быть небрежным, делать что-либо небрежно». Возможно, что это прозвище могло носить иронический оттенок. Однако более вероятно, что данное прозвище относится к охранительным именованиям. В данном случае, надеясь иметь аккуратного, опрятного мальчика, родители назвали его Кистяем. По другой версии, прозвище Кистяй могло иметь мордовские корни. Возможно, оно восходит к мокшанскому нарицательному «киста», которое на русский язык переводится как «дорога». Поэтому можно предположить, что как называли человека, который жил рядом с дорогой. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кистяй, со временем получил фамилию Кистяевы.