Фамилия Кистян — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять её смысл, нужно смотреть не на корень, а на суффикс и возможную географию. Основа «Кист-» в русских фамилиях встречается редко, и это сразу наводит на мысль о заимствовании или диалектном слове.

Самый вероятный путь — фамилия образована от прозвища или имени, которое могло быть связано с тюркскими языками. В тюркских языках есть слово «кист» или «кисти», означающее «часть», «доля», «кусок» или «отрезок». Прозвище Кистян могли дать человеку, который занимался дележом добычи, распределением земли или был известен своей придирчивостью к долям. Также существует версия, что основа восходит к слову «кисть» (руки или малярная), но в таком случае фамилия звучала бы как Кистев или Кистин. Форма на «-ян» здесь ключевая.

Суффикс «-ян» — типичный для армянских фамилий, где он указывает на принадлежность к роду или происхождение от предка. В русской среде он встречается реже, но мог появиться у обрусевших армян или народов Кавказа. Таким образом, фамилия Кистян с высокой вероятностью имеет армянские корни, а её основа — это либо тюркское заимствование, либо диалектное армянское слово. В армянском языке есть слово «кист» (կիստ) — «киста», но в качестве прозвища оно маловероятно, скорее это случайное совпадение.

Менее популярная, но возможная версия — фамилия могла возникнуть в среде донских или кубанских казаков, где было много контактов с тюрками. Прозвище Кистян могло закрепиться за человеком с характерной внешностью или особенностью речи, но точных документальных подтверждений этому нет. В любом случае, фамилия указывает на нестандартное происхождение: её носители, скорее всего, потомки выходцев из Закавказья, которые со временем влились в русскоязычную среду, сохранив родовой суффикс.