Фамилия Киткина — женская форма, в основе которой лежит мужское прозвище или имя Китка. Исходное слово «китка» могло попасть в фамилию двумя разными путями, и обе версии имеют право на существование.

Первая версия связывает прозвище с диалектным словом «кить». В пермских и сибирских говорах так называли мокрый снег, валящий хлопьями. Киткой могли прозвать ребёнка, родившегося в такую непогоду, — по обстоятельствам появления на свет. Это нередкая модель для русских прозвищ: погода, день недели, время года становились личным именем.

Вторая версия выводит Китку из женского имени Маргарита. В русской традиции длинные имена часто сокращали до простых форм: Маргарита → Рита → Кита → Китка. Маргарита в переводе с греческого — «жемчужина», и если фамилия пошла от этого корня, то её первоначальный смысл оказывается почти противоположным «снежной» версии — не хлопья снега, а драгоценный камень.

Фамилия образована по стандартной модели с суффиксом -ин, который в русском языке указывает на принадлежность: «чей?» — Киткин, то есть сын, потомок Китки. Такие фамилии типичны для северных и центральных регионов России, где отчества и прозвища на -ин закрепились раньше и плотнее, чем на юге. Выбрать между «снежной» и «жемчужной» версией без точных генеалогических записей сложно — обе лингвистически возможны, и реальное происхождение конкретной семьи могло быть связано с любой из них.