Фамилия Кизяев образована от прозвища Кизяй. В русских говорах словом «кизяй» называли сухой навоз, смешанный с соломой, который использовали как топливо в безлесных степных районах. Прозвище могли дать человеку, занимавшемуся заготовкой или продажей такого топлива, либо тому, кто жил в местности, где кизяк был основным источником тепла. В отличие от более известной фамилии Кизяков, где суффикс -ак- указывает на принадлежность к чему-то (например, «кизяк» — сам материал), фамилия Кизяев происходит напрямую от прозвища Кизяй, что встречается реже.

Суффикс -ев в фамилии указывает на патронимическое происхождение: Кизяев — буквально «сын Кизяя». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на мягкий согласный. Географически фамилия встречается в южных и центральных регионах России, особенно в областях, где было распространено земледелие и скотоводство, а кизяк использовали в быту. Встречаются также варианты написания Кизяёв, но основной формой остаётся Кизяев.

Стоит подчеркнуть, что прозвище Кизяй не обязательно несло негативный оттенок. В крестьянской среде занятия, связанные с добычей топлива, были обыденны и уважаемы, а прозвища часто давали по роду деятельности или месту жительства. В ономастических словарях (например, в работах Б. Унбегауна) подобные фамилии относят к разряду «ремесленных», хотя прямого упоминания Кизяева в них нет — это редкий случай, когда прозвище не перешло в массовую фамилию, а осталось локальным.