Фамилия Кизян звучит нехарактерно для привычного русского уха — в ней нет типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Её облик сразу указывает на восточное, скорее всего тюркское, происхождение. В русском языке такие фамилии обычно появлялись у народов Поволжья, Приуралья или Кавказа, которые входили в состав Российской империи и чьи имена и прозвища фиксировались в документах на русском языке.

Скорее всего, в основе фамилии лежит тюркское слово «кыз» — «девочка», «дочь». Суффикс -ян в таком контексте — типичный армянский или тюркский патронимический показатель, указывающий на принадлежность («из рода», «сын»). Таким образом, Кизян могло означать «сын девушки» или «принадлежащий к роду, где была только дочь». Однако есть и другая версия: в некоторых тюркских языках «кыз» могло быть частью личного имени (например, Кызбике — «девушка-госпожа»), и фамилия образована от него напрямую.

Менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с арабским или персидским корнем, означающим «скрытый» или «тайный», но для этого нет убедительных лингвистических свидетельств в русском ономастиконе. Поскольку фамилия редкая и не фиксируется в классических словарях русских фамилий (Унбегауна, Никонова), её носители, вероятно, происходят из небольшой локальной группы — например, из армянских общин, смешанных с тюркским населением, или из народов Северного Кавказа.

Географически фамилия Кизян встречается в основном на юге России, в Краснодарском и Ставропольском краях, а также в Армении. В дореволюционных метрических книгах её почти нет, что говорит о поздней письменной фиксации — скорее всего, фамилия оформилась уже в советское время, когда паспортизация закрепила за людьми их родовые прозвища. Предки современных Кизян, судя по всему, не принадлежали к дворянству или духовенству: это были крестьяне, ремесленники или мелкие торговцы, чья фамилия просто указывала на отца или родовое прозвище.