Фамилия Клачко звучит как что-то не до конца русское — и это верное ощущение. В ней нет типичных для великорусских фамилий суффиксов -ов, -ин или -ский, зато есть украинский уменьшительный суффикс -к(о), который превращает прозвище или профессию в фамилию-прозвище. Носители Клачко чаще всего встречаются на Украине и в южных областях России, в зоне исторического расселения украинцев.

Основа фамилии — «клач». В украинском и южнорусских говорах «клач» или «клачок» могло означать клок, клочок, пучок (шерсти, сена, волос). Отсюда первая версия: прозвище Клачко дали человеку с неопрятной, торчащей клоками шевелюрой или бородой. Вторая, не менее вероятная версия — профессиональная. «Клач» в некоторых диалектах называли ремесленника, который трепал шерсть и сбивал её в клочья (валяльщик, шерстобит). Фамилия могла закрепиться за таким мастером или за тем, кто торговал шерстью.

Третья, более редкая версия отсылает к глаголу «класти» (класть). В этом случае Клачко — тот, кто что-то кладёт: каменщик, печник или просто аккуратный человек. Но эта гипотеза слабее — глагольные прозвища с суффиксом -чк(-о) встречаются реже, чем от предметных.

Интересная деталь: фамилия Клачко могла изначально звучать как Клачков, но в украинской среде утратила конечный согласный и приобрела характерное окончание. Это хорошо видно по однокоренным фамилиям: на севере и востоке чаще встречаются Клачков и Клачкин (с русским суффиксом принадлежности), а на западе — Клачко, Клачок. Сравнение с ними подтверждает: основа едина, а региональная огранка разная.

В дореволюционных документах фамилия Клачко фиксировалась преимущественно среди казаков и крестьян Черниговской, Полтавской и Харьковской губерний. Дворянских родов с такой фамилией не известно — это фамилия простого люда, ремесленников и земледельцев.