Фамилия Клиначева — женская форма, а мужская, Клиначев, восходит к прозвищу или нецерковному имени Клинач. В русской ономастике суффикс -ач часто указывал на человека, склонного к какому-то действию или обладающего определённым качеством: рубак, силач, ткач. Клинач, вероятно, образован от глагола «клинать» — в старых говорах это означало «загонять клин», «раскалывать», «вклиниваться». Прозвище могли дать плотнику, который работал клиньями, или упрямому, «вклинивающемуся» в разговор человеку.

Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с диалектным словом «клин» в значении «участок земли». В таком случае Клинач — крестьянин, владевший или обрабатывавший узкий, клинообразный надел. В пользу этой гипотезы говорит распространённость «земельных» прозвищ в среде крестьянства центральной России, но против — редкость модели: обычно от «клина» образовывали фамилии через суффикс -ов (Клинов), а не -ач.

Фамилия редкая и географически не привязана к одному региону. Встречается в разрозненных записях по Вологодской, Костромской и Саратовской губерниям, что типично для прозвищ, разошедшихся с переселенцами. Суффикс -ев, а не -ов, указывает на основу на мягкий согласный (Клинач → Клиначев), и это дополнительно подтверждает, что исходное слово оканчивалось на -чь, а не на твёрдый звук.

Сословно фамилия почти наверняка крестьянская. Дворянские роды с таким окончанием почти не фиксируются, а в духовенстве фамилии чаще образовывали от названий церквей или латинских основ. Так что предки носительницы фамилии Клиначева — скорее всего, плотники, земледельцы или люди с цепким, «клиновым» характером из северных или среднерусских губерний.