Фамилия Клиненкова — женская форма мужской фамилии Клиненков, и ключ к её происхождению лежит не в прозвище «клин», как может показаться на первый взгляд, а в редком суффиксе -енк-. В русской ономастике суффикс -енко (в русской адаптации часто превращающийся в -енков) — верный признак украинского или белорусского корня. Если бы фамилия образовалась от слова «клин» напрямую, мы бы с большой вероятностью получили Клинков или Клинов. Форма Клиненков указывает на то, что в основе лежит имя или прозвище Клинко (Клинок), где -ко — уменьшительно-ласкательный суффикс, характерный для юго-западных земель.

Таким образом, предок носительницы фамилии, скорее всего, был человеком по имени или прозвищу Клинок. Что это могло означать? Самая прямая версия — прозвище по профессии: оружейник, изготовлявший клинки, или воин, мастерски владевший холодным оружием. Менее вероятно, но не исключено, что Клинком дразнили высокого, худощавого человека с резкими чертами лица — «острого», как клинок. Третья, бытовая версия: прозвище могло быть связано с деревянным клином — деталью в столярном или плотницком деле, и тогда предок был либо плотником, либо работал с бочками (бондарем).

Географически фамилия Клиненковы тяготеет к регионам, где проходила граница великорусских и малороссийских земель — Брянская, Курская, Белгородская области, а также юг современной России, куда украинские переселенцы приносили свои фамильные модели. В XIX веке при русификации фамилий суффикс -енко часто заменяли на -енков, чтобы привести фамилию в соответствие с русской грамматической нормой (на -ов/-ев). Поэтому Клиненков — это не исконная русская фамилия, а обрусевший вариант украинской фамилии Клиненко.

В написании Клиненкова стоит обратить внимание на букву «е» в корне: её часто путают с «и», ошибочно записывая фамилию как Клинёнкова или Клининкова. Однако корень здесь — именно -клин- (от «клинок»), и ударение в большинстве говоров падает на первый слог: КлИнéнкова.