Фамилия Клобуков — одна из тех, что напрямую отсылает к церковному быту. В её основе лежит прозвище Клобук, а то, в свою очередь, — от названия головного убора монахов и высших священнослужителей. Слово «клобук» пришло в русский язык из тюркских наречий, где означало «колпак» или «шапка». Конструкция клобука сложная: это цилиндр (камилавка) с прикреплённым к нему чёрным покрывалом, которое спускается на плечи и спину тремя длинными концами. Время появления этого облачения в монашеской традиции точно не установлено, но известно, что оно очень древнее. Славянскому «клобуку» у греков соответствовало «наглавие». Примечательно, что привычная нам форма камилавки — сравнительно поздняя: она была заимствована русской церковью у греков в XVII веке, в эпоху реформ патриарха Никона.

Разные чины духовенства носят клобуки с отличиями. Архиепископам полагается чёрный клобук с металлическим крестом (часто из драгоценных металлов или с алмазами), епископам — без креста. Белые клобуки с крестом — знак отличия митрополитов и патриарха. Патриарший клобук стоит особняком: он в форме сферического колпака, на вершине — крест, стороны украшены иконами, а на концах покрывала (кукуля) золотом вышиты серафимы.

Так какое отношение всё это имеет к фамилии Клобуков? Скорее всего, родоначальник фамилии был либо церковнослужителем, либо монахом, либо человеком, который изготавливал эти головные уборы. Прозвище Клобук закрепилось за ним, а потом перешло в фамилию по стандартной модели с суффиксом -ов. Важно, что в этом случае фамилия образована не от имени, а от названия предмета — характерный приём для русских «профессиональных» фамилий, указывающих на род занятий. Прямых аналогов, вроде Камилавкина, в русском ономастиконе практически нет, что делает фамилию Клобуков довольно редкой и узконаправленной по происхождению.