Фамилия Клюбко — редкий пример украинской модели фамилии, застывшей в форме прозвища. Суффикс -ко характерен для восточнославянских, особенно украинских, фамилий, образованных от личных имён, профессий или внешних черт. В данном случае основа «клюб» — не имя и не ремесло, а диалектное слово, что сразу же отличает эту фамилию от более прозрачных аналогов.

Корень «клюб» может восходить к нескольким источникам, и выбор версии зависит от региона. В украинских говорах «клюб» или «клюбка» — это палка, клюка, посох. Человек, носивший такое прозвище, мог хромать или опираться на палку, либо, напротив, быть пастухом, использовавшим клюку для ловли скота. Вторая версия, менее очевидная, связывает фамилию с диалектным глаголом «клюбитися» — клубиться, сбиваться в кучу. Так могли назвать общительного, компанейского человека или, наоборот, того, кто постоянно оказывался в центре толчеи.

С точки зрения словообразования, Клюбко — это не фамилия на -енко, как Клюбенко, а именно прозвище, которое напрямую стало фамилией. Суффикс -ко в украинской традиции мог выполнять функцию уменьшительности или принадлежности, но в фамилиях он часто просто фиксирует исходное прозвище без дополнительных морфологических наращений. Это делает фамилию более древней по типу образования, чем патронимы на -ович.

Географически фамилия тяготеет к западным и центральным областям Украины, где диалектная лексика сохранилась лучше. В России Клюбко встречается редко и, скорее всего, является следствием миграции украинских крестьян или казаков в XVIII–XIX веках. Сословная принадлежность носителей, судя по типу фамилии, — крестьянская или казачья; дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

В трудах по ономастике фамилия не получила широкого разбора, но её механизм образования типичен для украинских прозвищных фамилий. Сравните с однокоренными Ключка, Ключко, Клюбенко — все они указывают на связь с орудием труда или физической особенностью. Клюбко — не фамилия-загадка, а фамилия-характеристика, и её носителю стоит поискать корни именно в украинских сёлах, где пастухов и хромцов звали просто и метко.