Фамилия Клюшницина — женская форма от Клюшницин, но разбирать её стоит через мужской вариант, потому что именно он хранит исходное прозвище. Основа здесь — «клюшник». В старину так называли слугу, который ведал ключами, то есть ключника. Человек, отвечавший за замки, амбары, погреба и вообще за сохранность хозяйского добра. Должность эта была доверенная, не для первого встречного: ключник часто жил в барском доме и пользовался определённым влиянием.

Словообразовательная модель простая: от «клюшник» через притяжательное прилагательное «Клюшницин» (чей? — клюшников) с суффиксом -ин. Такие фамилии в XVI–XVII веках получали в основном люди из служилого или дворового сословия, у которых ремесло или должность отца становились родовым прозвищем. Суффикс -ин, а не -ов, указывает на основу на мягкий или шипящий согласный — это типично для русских фамилий от слов на -ник.

Интересная деталь: в некоторых говорах «клюшник» могло звучать как «ключник» (с утратой одного звука), но письменная фиксация фамилии сохранила именно форму с «ш» — Клюшников и, соответственно, Клюшницин. Встречаются оба варианта, и они не всегда означали одно и то же. Иногда «клюшник» — это не ключник, а тот, кто делает клюки (палки, посохи), но для фамилии Клюшницина первая версия — основная и самая вероятная.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России — там, где помещичье хозяйство было развито и требовало ключников. Среди крестьян-однодворцев фамилия встречается реже: должность ключника была скорее дворовой, нежели пашенной. В документах XIX века носители фамилии Клюшницины числятся в основном мещанами и купцами, что подтверждает связь с «ключом» как символом доступа к запасам и деньгам.

Женская форма Клюшницина не меняет смысла: это дочь или жена Клюшницина, то есть потомок того самого ключника. Фамилия не редкая, но и не массовая — её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких локальных родов, а не из разных концов страны.