Фамилия Кобус — редкий пример, когда прозвище перешло в наследственное имя почти без изменений, без типичных русских суффиксов -ов или -ин. Это указывает на то, что перед нами, скорее всего, фамилия не великорусского происхождения, а принесённая в Россию извне или сложившаяся на окраинах государства.

Самая вероятная версия — немецкие или еврейские корни. В немецком языке «Kobus» — это вариант библейского имени Якоб (Jakob), распространённый в католических землях Германии и Австрии. В таком случае фамилия образована напрямую от имени предка через усечение, что типично для немецкой ономастики. Менее популярная, но возможная версия — польское происхождение от слова «kobus» (кобчик, вид сокола). В польском языке это прозвище могли дать быстрому или хищному по характеру человеку, а фамилия звучала бы как Кобус или Кобусь.

На территории бывшей Российской империи фамилия Кобус встречается в западных губерниях — на стыке польского, белорусского и украинского влияния, а также у поволжских немцев. Если предки были немецкими колонистами, фамилия могла закрепиться в XVIII–XIX веках без изменений, так как немецкие фамилии в России часто не русифицировались суффиксами.

Словообразовательная модель здесь проста: основа фамилии совпадает с исходным именем или прозвищем. Отсутствие суффикса — главная подсказка. Если бы фамилия была исконно русской, мы бы ждали форму Кобусов (чей? — сын Кобуса). Раз её нет, значит, носитель фамилии или его ближайший предок не был крестьянином в центральной России, где патронимы на -ов были нормой. Скорее всего, это был горожанин, ремесленник или переселенец из немецких колоний.