Фамилия Кочаненко — классический пример украинской фамилии, образованной по самой массовой модели в этой языковой среде. Суффикс -енко указывает на происхождение от имени или прозвища отца: буквально «сын Кочана» или «маленький, молодой Кочан». В XVII–XIX веках такие фамилии были распространены сначала среди казачества и крестьян Левобережной Украины, а затем закрепились как наследственные.

Основа Кочан- имеет два основных объяснения. Первое — прозвище по внешности или характеру. В украинских говорах «кочан» (качан) — это вилок капусты. Так могли назвать коренастого, круглого человека или, напротив, того, кто ходит с неопрятной, торчащей шевелюрой (сравните с русским «вихор»). Второе — профессиональное прозвище огородника, торговавшего капустой, либо человека, занимавшегося её засолкой.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркским словом «коч» — кочевка, перекочевка. В таком случае прозвище могло указывать на пришлого, неоседлого человека. Однако для украинской антропонимики это редкий вариант, и первая версия — бытовая, по сходству с овощем — гораздо правдоподобнее и подтверждается параллелями вроде фамилий Капуста, Огурец, Редиска.

В сословном плане Кочаненко — фамилия крестьянская или казацкая, без дворянского корня. В реестрах Запорожского войска и переписях Полтавщины XVIII века встречаются однофамильцы с таким окончанием, что подтверждает её массовость в среде свободных военных поселенцев. Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины: Черкасской, Полтавской, Харьковской.

В русском языке фамилия склоняется по мужскому роду (Кочаненко, Кочаненко, Кочаненко), а женский вариант остаётся неизменным. Написание с одной «н» — нормативное для украинской модели, в отличие от белорусских фамилий на -енко, где двойная «н» встречается реже.